El imán genera el campo magnético  necesario para inducir las transiciones de RMN. Para mantener un sistema superconductor, el núcleo del imán se enfría a temperaturas muy bajas utilizando nitrógeno y helio líquido (para más detalles, ver la sección Imán y dewar del imán).

El sistema de homogeneidad  a temperatura ambiente, instalado en el extremo inferior del imán, es un conjunto de bobinas sobre las que se hace circular una corriente (conocidas como bobinas de shims) para maximizar la homogeneidad del campo compensando cualquier inhomogeneidad existente. La corriente que circula sobre las bobinas de shims de temperatura ambiente (llamados así porque no se enfrían por inmersión en un baño de helio líquido) se controla por el BSMS  y puede ajustarse desde el teclado BSMS para optimizar la señal de RMN. Este proceso tiene un efecto fundamental en la resolución y sensibilidad de la señal. A la acción de ajustar las corrientes de shim (corrientes homogeneizadoras) a temperatura ambiente se refiere como ajuste de la homogeneidad  (shimming) del imán.

Aunque el HPPR  (preamplificador de altas prestaciones) también transporta la señal transmitida hacia la muestra, se ocupa principalmente de las señales relativamente débiles emitidas por la muestra. Está situado en la base del imán para amplificar la señal de RMN tan pronto como sea posible y así minimizar las perdidas a lo largo del cable. Una vez que la señal se ha amplificado con el HPPR, la pérdida posterior por el cable es menos crítica. El HPPR también transmite y recibe las señales de referencia del deuterio (o flúor) y se usa en la rutina de sintonía (wobble). Se pueden configurar hasta 5 (HPPR) u 8 (HPPR/2 ) módulos individuales (excluyendo el módulo de la cubierta que siempre está presente). Una configuración muy típica está formada por tres módulos individuales, protón, X-BB y ²H junto con el módulo de cubierta.

La sonda se inserta en el sistema de homogeneización (shims) en la base del imán, y está formada esencialmente por diversas bobinas utilizadas para transmitir pulsos de excitación a la muestra, así como recibir la señal emitida. La sonda también transmite y recibe la señal de bloqueo de campo (conocida como señal de Lock).